负责水利工程项目的申报；指导农牧村饮水安全、牧区水利、节水灌溉项目的审查和工程建设与管理。指导全州水土流失综合防治工作。组织编制全州水土保持规划并协调实施，指导全州水土保持重点项目的实施，审核中小型生产建设项目水土保持方案并监督实施，生产建设项目水土保持设施验收鉴定。组织开展全州水土流失监测和监督检查，水土保持补偿费行政征收，不同行政区域之间发生的水土流失纠纷调解。指导全州农村水能资源开发、水电农村电气化县和以电代燃料工作的监督管理；拟订全州水能资源开发技术标准和规程规范；负责农村水电建后管理工作；提出水电资源开发、管理、改革的合理化建议；负责编制水能资源发展规划和年度计划的实施。